Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NPIPB13A6NJU9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms