Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPACA6W5XKT8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms