Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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