Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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HECTD4Q9Y4D8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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HECTD4Q9Y4D8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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