Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EMC9Q9Y3B6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMC9Q9Y3B6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms