Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMED7Q9Y3B3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMED7Q9Y3B3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms