Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NINLQ9Y2I6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NINLQ9Y2I6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms