Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTF2Q9UNY4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms