Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDRG4Q9ULP0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms