Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXD3Q9UJU5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms