Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATPIF1Q9UII2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPIF1Q9UII2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms