Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MED13Q9UHV7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms