Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms