Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPC1L1Q9UHC9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms