Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms