Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNNAL1Q9UBT7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms