Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SH3BP4Q9P0V3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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