Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms