Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM248Q9NWD8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM248Q9NWD8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms