Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX15Q9NRS6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX15Q9NRS6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms