Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AMBRA1Q9C0C7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms