Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM4Q9C037 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms