Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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