Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM54Q9BYV2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms