Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms