Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CINPQ9BW66 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms