Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP58Q9BVL2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms