Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MED18Q9BUE0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms