Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NDUFAF3Q9BU61 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NDUFAF3Q9BU61 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NDUFAF3Q9BU61 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NDUFAF3Q9BU61 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NDUFAF3Q9BU61 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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NDUFAF3Q9BU61 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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