Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
YIPF4Q9BSR8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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