Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NICN1Q9BSH3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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