Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms