Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms