Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms