Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LTV1Q96GA3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTV1Q96GA3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms