Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CPNE2Q96FN4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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