Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRT1Q96EB6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms