Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UTP4Q969X6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UTP4Q969X6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms