Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPTSSAQ969W0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPTSSAQ969W0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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