Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RFKQ969G6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms