Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED12Q93074 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED12Q93074 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED12Q93074 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED12Q93074 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms