Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOPBP1Q92547 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms