Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms