Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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