Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms