Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD35Q8N283 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms