Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf62Q7Z3J2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms