Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms