Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms