Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms